Wykrojniki laserowe, podobnie jak większość maszyn CNC, czytają kod G, który opisuje położenie i prędkość toru narzędzia. Użytkownicy zwykle nie przesyłają kodu G bezpośrednio; zamiast tego dostarczają pliki projektów, które operatorzy konwertują na kod G. Pliki DXF są powszechne do przedstawiania kształtów dwuwymiarowych w formacie wektorowym, zachowując odległości i warstwy. Na Atomm twórcy często dostarczają pliki XCS, które wykorzystują do trzech kolorów do oznaczania cięć, wydrążenia i grawerowania.